MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011726	AG	3	6	50	55	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011726	A	6	6	287	292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011726	AGC	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011726	CAT	2	6	347	352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011726	TAA	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011726	GAA	2	6	439	444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011726	GAT	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011726	AAG	2	6	505	510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011726	CGG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011726	A	6	6	1159	1164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011726	TCA	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011726	AATT	2	8	1205	1212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011726	TAA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011726	T	6	6	2671	2676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011726	TTC	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011726	AAC	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011726	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011726	TTAA	2	8	2934	2941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011726	CGAT	2	8	2971	2978	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011726	AT	4	8	2983	2990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011726	AATT	2	8	4122	4129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011726	T	6	6	4140	4145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011726	AC	3	6	4194	4199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011726	TAA	2	6	4201	4206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011726	TGA	2	6	5001	5006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011726	AAC	2	6	5017	5022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011726	TAA	2	6	5033	5038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011726	TTTA	2	8	5050	5057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011726	ATT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011726	GTT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011726	TAT	2	6	5384	5389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011726	ATC	2	6	10673	10678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011726	TGA	2	6	10687	10692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011726	CTA	2	6	10702	10707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011726	TAA	2	6	11578	11583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011726	GAT	2	6	11596	11601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011726	TCA	2	6	11622	11627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011726	AGTT	2	8	11663	11670	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011726	TGT	2	6	11677	11682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011726	AAT	2	6	11692	11697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011726	TTA	2	6	11704	11709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011726	TAAA	2	8	12724	12731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011726	A	6	6	12755	12760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011726	CACT	2	8	12809	12816	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011726	TTA	2	6	15576	15581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011726	AACT	2	8	16037	16044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011726	ACTT	2	8	16085	16092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011726	GATCA	2	10	16128	16137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011726	AT	3	6	16158	16163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011726	ATA	2	6	16225	16230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011726	AGA	2	6	16282	16287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011726	AAT	2	6	16293	16298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011726	AAT	2	6	16674	16679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011726	TAA	2	6	16691	16696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011726	A	6	6	17222	17227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011726	AGT	2	6	17230	17235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011726	A	7	7	17308	17314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011726	TTA	2	6	19014	19019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011726	T	6	6	19047	19052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011726	TAT	2	6	19084	19089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011726	AT	3	6	19088	19093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011726	CCT	2	6	19098	19103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011726	T	6	6	19165	19170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011726	TAATA	2	10	19193	19202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011726	A	6	6	19212	19217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011726	TCA	2	6	19285	19290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011726	TTC	2	6	23847	23852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011726	TGT	2	6	23868	23873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011726	CTA	2	6	23896	23901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011726	TTC	2	6	26335	26340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011726	TCT	2	6	26431	26436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011726	TAGT	2	8	26472	26479	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011726	T	6	6	27252	27257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011726	ATT	2	6	28636	28641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011726	TAA	2	6	28664	28669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011726	TCAT	2	8	28726	28733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011726	T	7	7	28749	28755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011726	A	7	7	28789	28795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011726	AAT	2	6	28877	28882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011726	A	6	6	28926	28931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011726	ATG	2	6	31181	31186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011726	CTT	2	6	31204	31209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011726	ACT	2	6	31241	31246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011726	TAG	2	6	31274	31279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011726	TAT	2	6	31297	31302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011726	TTC	2	6	31345	31350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011726	TGA	2	6	34106	34111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011726	TAC	2	6	34175	34180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011726	TGTT	3	12	34191	34202	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011726	TTG	2	6	34304	34309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011726	TAT	2	6	34347	34352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011726	ATTTT	2	10	34719	34728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011726	AAT	2	6	34738	34743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011726	ACT	2	6	34894	34899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011726	A	7	7	37557	37563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011726	A	7	7	37571	37577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011726	ATT	3	9	37607	37615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011726	T	6	6	37630	37635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011726	TAC	2	6	37642	37647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011726	ACC	2	6	37670	37675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011726	TAA	2	6	38779	38784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011726	CTC	2	6	40636	40641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_011726	TAC	2	6	40658	40663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011726	T	6	6	40666	40671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011726	TCC	2	6	40676	40681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011726	TGA	2	6	40719	40724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011726	CAA	2	6	40731	40736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011726	ATA	2	6	40766	40771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011726	ATG	2	6	40792	40797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011726	AG	3	6	40852	40857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011726	TCA	2	6	40861	40866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011726	A	6	6	40920	40925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011726	TTA	2	6	40944	40949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011726	A	6	6	42775	42780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011726	TTAG	2	8	44315	44322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011726	AT	3	6	45494	45499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011726	AAT	2	6	50997	51002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011726	AATCT	2	10	51913	51922	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011726	A	6	6	55002	55007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011726	ATT	2	6	56754	56759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011726	A	6	6	57527	57532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011726	TAG	2	6	57544	57549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011726	GGA	2	6	60195	60200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011726	ATT	3	9	60287	60295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011726	A	6	6	60299	60304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011726	A	7	7	60394	60400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011726	AAC	2	6	60404	60409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011726	AT	3	6	61853	61858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011726	TAT	2	6	61913	61918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011726	T	6	6	61946	61951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011726	TAAT	2	8	61958	61965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011726	ATC	3	9	62783	62791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011726	T	7	7	64367	64373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011726	CTC	2	6	64389	64394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011726	A	8	8	64416	64423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011726	ATC	2	6	64888	64893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011726	TAA	2	6	65994	65999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011726	AG	3	6	66095	66100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011726	CAA	2	6	66113	66118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011726	CTA	2	6	66148	66153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011726	TAC	2	6	66257	66262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011726	ATTG	2	8	66279	66286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011726	TCCT	2	8	66287	66294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011726	AGC	2	6	66311	66316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011726	TCT	2	6	66357	66362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011726	T	6	6	66362	66367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011726	CTA	2	6	66373	66378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011726	AAG	2	6	66497	66502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011726	GGA	2	6	66541	66546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011726	C	6	6	66625	66630	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_011726	CCG	2	6	68654	68659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_011726	ATT	2	6	71266	71271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011726	TATAG	2	10	71272	71281	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011726	TAA	3	9	71307	71315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011726	GTCC	2	8	71344	71351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NC_011726	GAT	2	6	71364	71369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011726	AGA	2	6	71392	71397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011726	TAA	2	6	71419	71424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011726	AGCA	2	8	71442	71449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_011726	ATTA	2	8	72176	72183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011726	A	6	6	76944	76949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011726	AATT	2	8	76989	76996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_011726	TAA	2	6	77045	77050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011726	TTAA	2	8	80812	80819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011726	GTTTAA	2	12	83710	83721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011726	T	6	6	85584	85589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011726	T	6	6	85595	85600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011726	AAT	2	6	85616	85621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_011726	TTAA	2	8	89973	89980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011726	TGACT	2	10	92343	92352	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_011726	GGA	2	6	92791	92796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_011726	CCT	2	6	92924	92929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_011726	CCT	2	6	92931	92936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_011726	GGT	2	6	94084	94089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_011726	ATCTTA	2	12	94143	94154	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
182	NC_011726	GA	3	6	94174	94179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_011726	ATT	2	6	94215	94220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011726	ATCT	2	8	95430	95437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
185	NC_011726	TAT	2	6	95498	95503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_011726	TCC	2	6	97000	97005	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
192	NC_011726	C	7	7	97010	97016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
193	NC_011726	A	6	6	97090	97095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_011726	GAT	2	6	97096	97101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_011726	TCG	2	6	97103	97108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
196	NC_011726	ATC	2	6	97121	97126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_011726	TAA	2	6	97129	97134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_011726	GTA	2	6	99986	99991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
199	NC_011726	TAT	2	6	99992	99997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_011726	ATT	2	6	128234	128239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_011726	TGT	2	6	128420	128425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_011726	AAT	2	6	130380	130385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_011726	ATC	2	6	130457	130462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_011726	ATC	2	6	130539	130544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_011726	TCC	2	6	132163	132168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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419	NC_011726	AAGTT	2	10	168681	168690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_011726	TAA	2	6	168906	168911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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435	NC_011726	AG	3	6	172706	172711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_011726	ATT	2	6	174324	174329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_011726	GAG	2	6	175098	175103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_011726	AAC	2	6	178686	178691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
460	NC_011726	TAA	2	6	178707	178712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_011726	AAT	2	6	179811	179816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_011726	ATT	2	6	179849	179854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_011726	TAA	2	6	181523	181528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_011726	ATT	2	6	181669	181674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_011726	CTT	2	6	181699	181704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_011726	AGG	3	9	182757	182765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011726	ATA	2	6	182809	182814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_011726	T	6	6	186809	186814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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